Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms