Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4BQ5PRF9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms