Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FREM1Q5H8C1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms