Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms