Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms