Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RAB6CQ53S08 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6CQ53S08 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms