Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms