Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms