Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms