Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms