Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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