Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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