Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms