Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPROQ16827 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPROQ16827 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPROQ16827 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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