Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms