Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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