Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms