Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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