Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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