Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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