Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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