Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSC22D1Q15714 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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