Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCEA2Q15560 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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