Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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