Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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