Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIXQ14938 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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