Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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