Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms