Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms