Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTTNQ14247 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms