Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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