Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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