Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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