Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CUL3Q13618 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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