Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms