Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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