Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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