Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms