Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms