Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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