Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms