Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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