Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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