Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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