Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms