Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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