Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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