Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms