Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms