Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms